В общем посыпался профиль пользователя.
Удали все файлы кроме папок пользователя
/home/user/
У меня имя пользователя user
калька последняя версия.
После перезагрузки предложило использовать профиль по умолчанию.
Тему выбрал в профиле calculate
значки и рамка окна появилась.
app-admin/eselect делал.
Раз ответа нет, переустановил систему и скопировал пустой профиль пользователя, на будущее, вдруг будет аналогичная проблема.
Я бы предложил такой рецепт:
# переименовать в /home/user2
# войти в сеанс
# скопировать настройки из user2: .config/chromium, .purple, .claws-mail, .config/hexchat + то, чем пользовались (например .wine)
# перенести данные
# через какое-то время можно удалить /home/user2