После установки нового ядра, как и было предложено выполнил:
# module-rebuild -X rebuild
Но получил сообщение о неразрешимости имен:
** Packages which I will emerge are:
sys-kernel/bbswitch
net-wireless/broadcom-sta
net-wireless/madwifi-ng
x11-drivers/nvidia-drivers
sys-power/bbswitch
5 4 3 2 1
emerge: there are no ebuilds to satisfy "sys-kernel/bbswitch".
emerge: searching for similar names...
emerge: Maybe you meant any of these: sys-power/bbswitch, sys-kernel/spl, sys-kernel/kccmp?
Пришлось пересобирать вручную. Проблема в пакете bbswitch, используется для переключения дискретной и встроенной видеокарт. Когда-то он был в оверлее mva в разделе sys-kernel, позже был перенесен в другой оверлей в sys-power, eix находит только sys-power/bbswitch.
Как убрать sys-kernel/bbswitch при пересборке модулей?