Видать что-то поменялось в логике запуска KDE, а может и вообще иксов, но теперь переста подхватываться .bash_profile из home-каталога.
Т.е. как это проявляется.
Если я из Kate пытаюсь вызвать команду make (через модуль для сборки),
то PATH выглыдит так “/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/opt/bin:/usr/x86_64-pc-linux-gnu/gcc-bin/4.9.3:/usr/games/bin”
Если же я запущу из Konsole тот же make, то PATH уже будет нормальным
“/home/user/.cargo/bin:/home/user/.local/bin:.:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/opt/bin:/usr/x86_64-pc-linux-gnu/gcc-bin/4.9.3:/usr/games/bin”
Потыкался в настройках системы в KDE и ничего не нашёл.
Что-то я даже не понимаю куда копать.