hostname -d

никак не могу установить cl-setup proxy ,вываливается ошибка *error: not found domain name
command ‘hostname -d’ returns an emty value*
но компьютер виден в домене винды .

Добейтесь чтобы выдавалось правильное DNS имя домена при выполнении команды hostname -d
Файл /etc/hosts
Samba домен и DNS домен это разные вещи.

В файл /etc/conf.d/net нужно добавить:

domainname=“domain.local”

Файл /etc/hosts к этому никакого отношения не имеет.