Вот в кратце как ругается подскажите куда копать и стоит-ли настраивать ядро оно по умолчанию.
…
ERROR: dev-lang/mono-4.4.1.0::gentoo failed (pretend phase):
* Kernel not configured; no .config found in /lib/modules/4.4.39-calculate/build
…
emerge --usepkg-exclude mono docky. Эта проблема не относится к DE (Cinnamon, Mate и т.д.) Ядро обновили и “неиспользуемый пакет calculate-sources-4.4.39” удалили? А разработчики, возможно, не поторопились так же быстро пересобрать пакеты, использующие, например, модули ядра. И надо либо заставить соответствующие пакеты компилироваться, либо тупо создать фиктивные символические ссылки в /lib/modules и /usr/src.
Спасибо огромное я просто впервые столкнулся с данной вещью. И самое интересное что на cls все собирается. А я сейчас посмотрел да я его давненько не обновлял. На cinnamon тоже собирается правда сейчас в процессе жду.
В CLS собирался из исходников. Недавно ошибочно включили в бинарные. Для версии 4.8 ebuild поправили, в 4.4 исправления ещё нет. Перенесём 4.4 в оверлей calculate.