Подводя результат из всего выше сказанного, чтобы новым пользователям было более понятно решение, сгруппированный результат выглядит так (на авторство не претендую, просто подведение итогов):
#Подключение и синхронизация репозитория linuxbuh от автора ztime
eselect repository add linuxbuh git https://github.com/linuxbuh/linuxbuh.git
eix-sync && eix-update
#В дальнейшем синхронизацию данного репозитория можно делать просто по
emaint sync -r linuxbuh
#Размаскировка программ
emerge chromium-gost cryptoprocsp cades IFCPlugin --autounmask-write
#проверка конфигурационных файлов на изменение и принятие изменений по нажатию “u”
dispatch-conf
#Установка программ
emerge chromium-gost cryptoprocsp cades IFCPlugin
#Если нужны драйвера для Rutoken
emerge ifd-rutokens --autounmask-write
dispatch-conf
emerge ifd-rutokens
Подсказка по установке сертификатов и контейнеров располагается выше, вот ссылка:
Установка сертификатов (руководство от SLYUSARDI)
PS. Огромное спасибо за помощь в решении столь сложного вопроса всем и особенно ztime, SLYUSARDI, NickM!