Шаблон можно создать непосредственно в /var/calculate/templates со всеми необходимыми условиями
# Calculate format=diff env=install ac_install_patch==on&&merge(sys-apps/coreutils)==8.21
содержимое патча
Если используете builder и assemble (эти пакеты используют шаблоны весии 2.2), то патч стоит поместить в каталог 3.1 c условием
# Calculate append=skip cl_name==calculate-core&&cl_ver>=3.1.1